细胞命运研究新工具的开发
新工具的开发是科学研究的重要组成,也是许多重大突破的重要前提。
Miguel A. Esteban、张必良和鲍习琛领衔的科研团队利用点击化学-核酸标记技术设计了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技术,巧妙地将新合成的RNA标记上生物素,通过链霉亲和素偶联的磁珠,分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子。 该新技术将成为全面分析细胞内的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭开基因组中的”暗物质”-非编码RNA的未知功能(Nature Methods,2018)。
张小飞在Nature Protocols(2018)撰文报道了一种泛素相互作用亲和富集-质谱(简称”UbIA-MS”)的方法。该方法利用点击化学和蛋白质谱联用可以全面快速鉴定来自细胞裂解液中所有泛素链的相互作用蛋白。同时,该篇指南论文提供的数据分析软件,可以用于快速地分析其他蛋白质谱相关数据,同时给出不同类型的数据图表。
Ralf Jauch课题组将蛋白质工程和细胞重编程结合,在关键位点引入随机化突变,筛选出功能增强的、可加速体细胞重编程的蛋白因子。利用这种方法,研究人员发现了数十种人工进化和增强的重编程因子。这些转录因子比传统的转录因子在诱导体细胞重编程上表现更加优异。该研究为提高体细胞重编程效率和体细胞之间的直接相互转化提供了新途径(Stem Cell Reports,2018)。该课题组还首次实验证明了转录因子FOXA1蛋白的新的二聚结合形式。转录因子蛋白FOXA1在细胞增殖、分化、胚胎成长、器官发育、肿瘤的产生与发展等过程中起着重要的作用。基因组测序结果显示,在乳腺癌和肝癌细胞中FOXA1蛋白在二聚体基序上富集并能够在PI3K信号通路被抑制的时候调控染色质动态变化。并进一步筛选出能够影响FOXA1二聚结合的与疾病相关的单核苷酸多态性(SNP),其中有着与骨质疏松及帕金森疾病相关的致病SNP,为未来相关疾病的研究治疗提供了新的方向(Nucleic Acids Research,2018)。
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